高新技術企業仍是稅收制度支持的重點項目，《教育部、司法部、商務部關于修改印發〈高新技術企業認定管理的必要性〉的通知》(郭克火發〔2016〕32號，以下簡稱32號文件)和〈高新技術企業認定管理的必要性〉的通知》(郭克火發〔20〕代理登記公司08號，以下簡稱172號文件)
認定前提的變更
在各方面認定的前提下，32號文件取消了“近三年”的周限；取消“以獨占許可方式取得技術著作權5年以上”等。，具體變化見右側表格。
識別程序的變更
32號文件認定程序發生了變化，納稅時需要注意。
1 .高新技術企業資質仍有審查程序。
2.申請高新技術企業資格的企業，在提交的申請資料中增加“近三個財政年度高新技術產品(公共服務)收入專項審計或司法調查報告”和“近三個財政年度企業個人所得稅納稅申報表”。
3.審計認定的公休日從15個減少到10個，提高了工作效率。
4.進一步明確享受稅收優惠的起止周:
取得高新技術企業資格后，企業從頒發高新技術企業證書當年起享受稅收優惠。
認定的高新技術企業因審查后發現不符合高新技術企業認定前提而被取消高新技術資格的，稅務機關將收回其今年以來享受的稅收優惠。
對認定的高新技術企業，因弄虛作假、違法違規行為、未按時履行查處和報告責任等原因被取消高新技術資格的，稅務機關可收回其自上述行為發生之日起已享受的高新技術企業稅收優惠。另32號文件取消了172號文件中“政府機構仍將在5月內受理企業的認定申請”的明確規定
5.特定高新技術企業獨立調查報告的責任:
企業取得高新技術企業資格后，應當填寫當年的版權、科研、研發費用、營業收入等可持續發展過程。在每年5月初前在“高新技術企業代理注冊公司行業認證管理網”注冊；
高新技術企業在認定的前提下發生更名或相關根本性變化(如分立、合并、重組和經營管理的業務變更等。)，并應在三個月內查明政府機構的調查報告。172號文件明確規定，具體情況發生時，15日內確認政府機構的調查報告，32號文件的調查報告期限放寬，更有利于納稅。
補充“未按計劃調查與認定前提相關的根本性變化，或兩年內未報告本年度可持續發展進程的，將被取消資格。”
6.當新增加的高新技術企業跨越政府認可機構的管理工作領域時，高新技術資格難以延續:
代理注冊公司如果企業在高新技術資質有效期內完成整體遷移，資質繼續有效。
企業部分搬遷的，政府機構的新認定由企業搬遷地確認。
企業將在高新技術資格有效期內遷移，32號文件沒有規定相關資格的續展問題，在實際操作中，新的高新技術資格應得到遷移地政府機構的認可。
7.企業偷稅、騙稅的，仍將視為取消高新技術資格的情形之一。
各個領域的新支持
隨著國家院經濟發展趨勢和制造業的一體化，32號文件所附“國家院重點項目支持的高新技術領域”中所列的細節變化比172號文件所列的要少，主要是因為增加了國家院重點項目支持的新企業，如在“生物醫藥”戰壕中增加了“服務平臺和移動互聯網應用”、“無線通信系統新技術”；在“新能源”戰壕中，加入了“與文化審美制造相關的新能源”；在“高科技公共服務”的溝渠中，新增了“信息系統公共服務”、“IT與現代倉儲新技術”，目前仍在細化。
高技術企業認定前提下的東西方比較
單擊查看最近確定的必要管理工作:
教育部、司法部、商務部關于修訂印發《高新技術企業管理的必要性》的通知(郭克火發〔2016〕32號)