1.《會計法》對代理記賬的宣傳力度不夠，導致很多小型經濟組織， 代理記賬，尤其是廣大個體工商戶，對“代理記賬”知之甚少。
2.“代理記賬”的措施不是很有效。目前，小經濟組織和個體工商戶代理開戶存在兩個主要問題。一個是不開戶就開戶很常見，另一個是很多“記賬代理人”不具備合法資格。這不僅干擾了法律的嚴肅性，還容易導致許多其他問題。
3.在代理記賬的法律關系上，應該說受托人的法律地位還沒有完全解決，實踐中爭議較大。
4.簿記代理的潛力沒有得到充分利用。代理記賬機構數量不斷增加，但整體規模普遍較小，代理業務范圍也不廣。真正能提供會計、稅務籌劃、納稅申報、內部審計、工商稅務登記年檢、財稅咨詢等全方位會計服務的機構很少。
5.記賬機構的設立不規范。代理記賬機構必須有3名以上持有會計從業資格證書的專職人員，代理記賬業務負責人必須具有會計師以上專業技術職稱資格。然而，在實踐中，相當多的記賬機構不符合這一要求。
6.代理記賬機構內部管理混亂。實踐中很多代理記賬操作不規范，內部管理制度不健全。即使制定了一些代理記賬機構的內部管理制度，也是沒有用的。
7.代理記賬的執業質量不容樂觀。會計中仍有許多不規范之處，其中一些不是基于權責發生制。代理公司未按《公司法》規定提取法定公積金和法定公益金的情況也很常見。代理機構編制的年度財務會計報告只有基本會計報表，會計報表附注的內容沒有按照系統要求提供。
8.代理記賬業務收費標準混亂。在收費標準上，不同的記賬機構差異很大。有些記賬機構甚至通過低價進行惡意競爭，而有些記賬機構不規范自己的營業收入核算，隱瞞收入的現象也很普遍。企業咨詢認證網有個論壇 。可以去那里，不行的話問問里面的咨詢公司，會有人來接帖子的。